塔斯馬尼亞虎成為第一種提取RNA的滅絕動物

塔斯馬尼亞虎有一個漫長而曲折的歷史現(xiàn)在，這包括成為科學家從中恢復RNA的第一個滅絕動物家族，RNA是使物種基因組栩栩如生的分子。

通過一種經(jīng)過特殊修改的方案，瑞典團隊從132歲的塔斯馬尼亞虎或袋狼的皮膚和肌肉中提取了數(shù)百萬條RNA鏈。

被科學家稱為袋狼，條紋，肉食性有袋動物是被獵殺至滅絕1930年代在澳大利亞塔斯馬尼亞島上。

從袋狼等滅絕動物身上恢復RNA（將DNA中編碼的信息轉(zhuǎn)化為蛋白質(zhì)的遺傳物質(zhì)）可以打開有關基因活性的信息寶庫。思緒已久.

“活細胞中不再存在的RNA表達譜的恢復擴大了深入研究滅絕動物生物學的可能性，”斯德哥爾摩大學的生物信息學家Emilio Mármol-Sánchez及其同事在他們發(fā)表的論文中寫道.

“這是我們第一次瞥見袋狼特異性調(diào)控基因的存在，例如microRNA，這些基因在一個多世紀前就滅絕了”，增加斯德哥爾摩大學的分子生物學家Marc Friedl?nder。

雖然讀取DNA序列告訴我們一個物種具有哪些基因，但RNA序列揭示了哪些基因?qū)嶋H上被“打開”并用于在細胞內(nèi)制造蛋白質(zhì)。但RNA要脆弱得多，并且會分解快得多，快得多而不是DNA，因此搶救歷史樣本具有挑戰(zhàn)性 - 但并非不可能。

Mármol-Sánchez及其同事從袋狼標本中采集了六個肌肉和皮膚樣本，該標本于1891年被編目并擱置在斯德哥爾摩的自然歷史博物館。

從132歲的袋狼身上回收的RNA并不是最古老的，而且相去甚遠。近年來，RNA已被從狗狀犬科動物在永久凍土中保存了大約 14,300 年，從 5,300 年的歷史開始木乃伊人類冰人.

古代狼沒有明確的分類等級，但它的家族一直活到今天，這意味著袋狼是第一個真正滅絕的動物，其RNA被恢復。

它的一些RNA顯示出損壞的跡象，當保存數(shù)百或數(shù)千年或使用防腐化學品時，這是可以預期的。

這些樣本也受到人類和可能的細菌RNA的污染，但研究人員能夠通過將它們與袋狼RNA序列相匹配來確認袋狼RNA序列的真實性。物種的基因組.

在肌肉樣本中，他們發(fā)現(xiàn)了編碼組織特異性蛋白質(zhì)的RNA，包括titin和actin，它們允許肌肉纖維伸展和收縮，而在皮膚中，RNA編碼一種叫做角蛋白的結構蛋白。

“轉(zhuǎn)錄譜與現(xiàn)存物種的轉(zhuǎn)錄圖非常相似，揭示了特定的解剖學特征，例如[骨骼肌樣本中的]慢肌纖維或血液浸潤，”Mármol-Sánchez及其同事寫.

研究小組對他們的發(fā)現(xiàn)感到興奮，他們希望這將有助于正在進行的努力復活袋狼，一個籌集了許多資金的項目倫理和技術問題.

但更重要的是，對滅絕物種的RNA進行測序可以為研究人員提供檢測不同RNA存在的機會。病毒隨著時間的推移，這可能會加速我們對病毒進化的理解。

“它們在如此古老的遺骸中的存在表明，有可能從博物館干藏品中儲存的現(xiàn)存和滅絕物種的標本中分析RNA病毒組，”Mármol-Sánchez及其同事寫.

盡管這些調(diào)查對科學家來說可能很有趣，但另一個有效的問題是，來自澳大利亞前哨島嶼的袋狼標本是如何最終進入瑞典博物館的，距離它曾經(jīng)居住的地方有半個地球。

該研究已發(fā)表在基因組研究.

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